PubMed检索与利用,,医药文献检索,药物化学教研室 张玲 2010.3.25,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,总结,检索结果的处理,一、简介,由美国国立医学图书馆（NLM）所属国家生物技术信息中心(NCBI) 建立；,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/,收录范围,MEDLINE 记录标注PubMed - indexed for MEDLINE PreMedline 是临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向medline移加一次 记录标注PubMed - in process Publisher supplied citations 出版商直接向PubMed递送的电子记录中不被Medline收录的部分 记录标注PubMed - as supplied by publisher,MEDLINE数据库由美国国家医学图书馆（National Library of Medicine，简称NLM）编制，是印刷刊Index Medicus（医学索引）、Index to Dental Literature（牙科文献索引）和Internationgal Nursing Index（国际护理索引）的光盘版，数据摘自3700种期刊，是生物医学的主要数据库。
时间跨度1966年至今简介,PubMed的特点,二、PubMed的特点,免费提供题录和文摘 可与提供原文的网址链接 (部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷,,自动转换匹配： PubMed对输入检索框中的检索词进行智能化地校对，将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配的原则MeSH Translation Table 主题词注释表,Journals Translation Table 期刊注释表,Common Phrase List 常用词组表,Author Index 作者索引表,No Mapping,,,,检索词拆分AND,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,,基本检索输入框,,特征栏提供辅助 检索功能,,侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索、特定文献检索,,,执行检索按钮,,Journals DatabaseMeSH DatabaseSingle Citation MatcherBatch Citation MatcherClinical QueriesSpecial QueriesLinkOutMy NCBI,三、PubMed检索界面,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,（五）带逻辑运算符的复合检索,在PubMed基本检索里面的前面四项其实也就是告诉我们在基本检索输入框中，可以输入任何具有实质性意义的词语，比如说：自由词、主题词、人名或者刊名，系统都会智能化地同系统中词表的进行匹配后完成检索。
在基本检索里面，PubMed能够完成：,1、单词、短语、词组检索,2、作者检索,3、期刊名称检索,4、截词检索,5、带逻辑运算符的复合检索式,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,主题词,以规范化的词汇来表达文献内容的主题，这种词汇叫主题词(叙词) 医学主题词表 美国国立医学图书馆邀请专家、学者汇集约16,000多个医学主题词并加以整理，使之规范化，编制成的一个表，即医学主题词表(Medical Subject Headings，简称Mesh) MeSH 附有各种参照和注释，它是对生物医学文献进行标引和检索的依据医学主题词表的作用,在标引人员将情报输入检索系统以及检索者(用户)利用系统内情报这两个过程中，以主题词作为标准用语，使标引和检索之间用语一致，达到最佳检索效果在手工和联机检索前，查阅医学主题词表是制定检索策略的重要依据 cancer、carcinoma、tumor、neoplasms,医学主题词表主要包括下面三部分 主题词变更表 、年新增主题词 、年删去主题词 、年累积新增主题词 字顺表(Alphabetic List) 字顺表将主题词、次要主题词(非主题词)、款目词(非主题词)按字顺统一排列。
范畴表(Categories and Subcategories),选择规范化主题词要注意的几个问题,1.对于自然医学语汇中同义词、近义词、学名与俗名的处理 例： Cancer * Neoplasms (近义词) German Meales * Rubella (同义词) Vitaman C * Ascorbic Acid (学、俗名) Apoplexy * Cerbrovascular Disorders(同义词) Deoxyribonucleic Acid * DNA (繁、简称) 有“*”者为IM规范化主题词2. 倒置主题词 倒置主题词就是把复合主题词中被修饰的名词作为标目，放前面定语放在名词之后，并用逗号分开这样，可使医学概念相近的族性词汇集中在同一主题下，便于检索例： SHOCK, CARDIOGENIC (心源性休克) SHOCK, HEMORRHAGIC(出血性休克) SHOCK, SEPTIC (败血性休克) SHOCK, SORGICAL (外科性休克) SHOCK, TRAUMATIC(创伤性休克) 例中的复合主题词经倒置后，各种有关休克的文献都集中在SHOCK这个主题词下。
3. 主题词与副主题词的组配使用,为了使主题词的专指性更强，主题词要与副主题词组配使用 副主题词又称限定词(Qualifiers)，用它将某一主题词的概念进行复分，使主题词具有更高的专指性 在一个主题词下面往往收录了许多篇文献，为了让读者不必花太多时间从关到尾一题不漏地看所有题录，就在每一个主题词下面又用若干副主题词，以便把内容相近的文献集中到相应的副主题词下面，让读者有目的地选择查阅 1989-1990年IM使用的副主题词是77个，1991-1994年是80个范畴表(Categories and Subcategories),范畴表又称树形结构(Tree Structure)此表是将字顺表中的主题词(主要叙词)、次要叙词按其学科性质、词义范围的上下类属及派生关系，分别划为15大类依次用A-N，Z代表在15个类目中，有9类又分若干子类目，加用数字代表，子类目共有101个子类目下面又分若干更小的类目，这就是通常供检索使用的主题词，共一万六千多个，都按其医学概念的性质分别列入各自所属的类目之下GASTROINTESTINAL NEOPLASMS 胃肠肿瘤 INTESTINAL NEOPLASMS 肠肿瘤 CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤 COLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤 COLONIC POLYPS 结肠息肉 ... ... ... ... DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤 ILEAL NEOPLASMS 回肠肿瘤 ... ... ... ...,字顺表与树形结构(范畴表)在功能上的关系及如何利用,查全率与查准率是文献检索的两大要素，这两者关系到词表的科学设计。
医学主题词表通过“字顺表”反映主题词之间的横向关系，通过“树状结构”揭示词与词之间的纵向隶属关系两个表相互配合，形成一个功能完善的检索体系，以满足检索者对文献查准与查全要求检索出文章总篇数,综述类文献总篇数,单词检索,,系统自动进行转换匹配后生成的检索式,,Liver cancer,固定搭配 词组检索,可以保证查全率,,自动转换匹配后，进行逻辑或的运算,短语检索,自动转换匹配后的结果,,强制短语/词组检索,,,针对特定的短语和词组的检索，需要在短语或者词组上加上双引号简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,作者姓名检索,格式：姓+名缩写(不用标点)，如要查找王智彪教授发表的文章，输入格式为：wang zb，系统会自动在作者字段内进行检索简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,建议期刊检索使用期刊名称检索字段标识ta或者是so,这是因为： 如果期刊名称正好是一个MeSH中的词，系统会将其作MeSH词进行检索。
如果期刊名称是一个单词，系统会在所有字段中进行检索简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,在词的末尾加“*”号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词截词检索将关闭自动词语匹配功能简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,（五）带逻辑运算符的复合检索,如我们要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献，我们可以在基本检索输入框中输入：cancer AND (diagnosis OR therapy)，点击“Go”进行检索复合检索式检索,布尔逻辑运算符有: AND，OR或NOT,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索,检索史管理,预检索及浏览索引检索,详细匹配过程,剪贴板,界面介绍,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,输入检索词，系统默认空格为AND关系,子文档,检索词字段,出版类型 选择限制,文献发表日期,只要有文摘的文献,语种,研究对象年龄,限制字段和条件检索（Limits）,性别,数据输入时间,研究对象,将检索词限制在一个特定范围,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览索引检索（Preview/Index）,检索式,预检索/索引加词检索,预检索按钮,,索引检索按钮,预检索/浏览索引检索界面（Preview/Index）,检索结果数量,therapy,预览检索结果，修改和增删检索词,,步骤2 输入待选词,,步骤1 点击预览/索引按钮,hepatitis b,步骤3 点击index按钮,,步骤5 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系,步骤4 索引选词,,,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览检索（Preview/Index）,检索史管理（History）,,检索历史回顾,检索式,检索时间,检出篇数,,,点击预检索按钮,#1 and therapy,用于查看检索记录和检索结果的数量，并进行各种逻辑运算。
检索史管理界面（History）,检索号,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览检索（Preview/Index）,检索史管理（History）,剪贴板管理（Clipboard）,剪贴板管理界面（Clipboard）,暂存需下载或者是打印的记录，多项检索后集中存盘或者打印最多允许存储1000条简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览检索（Preview/Index）,检索史管理（History）,剪贴板管理（Clipboard）,详细匹配过程（Details）,详细匹配过程界面（Details）,点击后，系统可以把我们真正执行了自动匹配转换功能的检索式显示出来，可以看见系统详细的转换过程数据库匹配过程,规范词转换,你输入的检索式,,检索明细,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,临床查询,,,期刊浏览检索,,,主题词浏览检索,,,单个引文匹配器,,,批引文匹配器,,,临床查询,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,,期刊浏览检索,（一）期刊浏览检索 （Journal database）,cancer,点击,,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,,期刊浏览检索,主题词浏览检索,（二）主题浏览检索 （Mesh Database）,功能： 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词,,主题词数据库检索,1.输入检索词,3.点按此处可获详细注解,,2.执行浏览,主题词注释,可选副主题词,限定作为主要主题词检索,不进行下位词扩检,该主题词所替代的非规范词形式,主题词树形结构表,发送至检索框,通过MeSH Database 检索的结果，其中32篇综述文献,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,（三）单个引文匹配检索 （Mesh Database）,输入题录信息，查找特定文献。
刊名要准确，缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如查找：王智彪教授1997年发表在Ultrason Sonochem期刊上的一篇文章的其他作者的名字,,单个引文匹配检索,Ultrason Sonochem,1997,Wang zb,,得出其他著者,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,临床查询,（四）临床查询 （ Clinical Queries ）,检索临床研究方法学（循证医学）文献，主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类，并提供强调选择，即敏感度（强调查全）或专指度（强调查准）有三个方面的内容： 研究类别查询：治疗、诊断、病因学及预后 系统评价查询 医学遗传学查询 ：诊断 、临床描述、管理、基因、分子遗传学、基因测试等内容研究类别查询,系统评价查询,医学遗传学查询,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),,输出到文本（send to Text),输出到文件（send to File ),输出到E-mail（send to E-mail),简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,,显示检索结果(Display),显示检索结果(Display),检索格式选择,显示记录数,排序方式,有摘要,有free全文,无摘要,,全文链接图标,,,点击下载PDF 格式的全文,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),检索结果输出（send to ),Text：当前网页所显示记录的文本格式，用浏览器文件菜单中的保存文件的功能保存文件。
File：所有记录纯文本文件格式，用对话框保存 Clipboad： 剪贴板，暂存需下载记录，多项检索后一起保存 Email： 通过邮件发送文献，最多500篇文献简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),,输出到文本（send to Text),检索结果输出（send to Text)：当前网页所显示记录的文本格式，用浏览器文件保存保存该文本文件,打印该文本文件,,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),,输出到文本（send to Text),输出到文件（send to File ),检索结果输出（send to File )：以纯文本文件保存，注意的是，在display中的显示格式就是存盘的格式,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),,输出到文本（send to Text),输出到文件（send to File ),输出到E-mail（send to E-mail),检索结果输出（send to E-mail)：通过邮件发送检索结果。
简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,总结,检索结果的处理,八、总结,Preview/Index：建议多使用，便于节省检索时间，修正检索策略，得出最佳检索策略 History：进行多项组合检索 检索词：不区分检索词的大小写,双引号作用： 在对一些特定内容（如作者名，期刊名）进行检索时 进行特定短语搜索时，强制短语检索 检索标签：应用方括号括起来，不区分字母大小写，不区分检索标签与检索词之间是否有空格 利用通配符*进行检索：可以查全因为词性变化的文献,The End,。