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粪便基因组DNA快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书

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粪便基因组DNA快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书_第1页
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粪便基因组DNA快速提取试剂盒目录号:DN23目录编号包装单位DN230150次❖ 适用范围:适用于快速提取各种粪便DNA❖ 试剂盒组成、储存、稳定性:试剂盒组成 保存 50次70 ml缓冲液ASL 室温杂质清除剂AB 室温结合液CB 室温抑制物去除液IR 室温漂洗液WB 室温洗脱缓冲液EB 室温蛋白酶K粉(可选) g-20°C—20mg/ml吸附柱AC 室温收集管(2ml) 室温5 ml11 ml25 ml15 ml第一次使用前按说明加指定量乙醇15 ml20mg50个50个本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果杂质清除剂AB升级,可以室温存放,使用更方便储存事项:1. 缓冲液ASL或者结合液CB低温时可能出现析出和沉淀,可以在70°C水浴几分钟 帮助重新充分溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用2. 为避免降低活性,方便运输,提供蛋白酶K为冻干粉状,收到后,可短暂离心后, 加入1毫升灭菌水溶解,因为反复冻融可能会降低酶活性,因此溶解后立即按照 每次使用量(20微升)分装冻存,一20C保存3. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时 盖紧盖子❖ 产品介绍:常规的DNA纯化方式并不能有效地去除粪便中存在的大量抑制因子而导致下游 实验的失败,如PCR不能扩增出所需片段。

该试剂盒采用DNA吸附柱和新型独特的 溶液系统,能有效去除动物粪便中各种影响下游实验(如PCR)的抑制因子,并能高 效地回收粪便中的基因组DNA动物粪便样品经特殊缓冲液ASL重悬后,70C处理5 分钟裂解细菌;离心去除不溶解的杂质,蛋白酶K消化进一步去除蛋白和杂质;然后 基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速 的漂洗一离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最 后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱❖ 产品特点:1. 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端2. 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤3. 快速,简捷,单个样品操作一般可在40分钟内完成4. 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7〜1.9,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应❖ 注意事项1. 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,OOOrpm的传统台式离心机, 如Eppendorf 5415C或者类似离心机。

2. 开始实验前将需要的水浴先预热到70°C备用3. 结合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避 免沾染皮肤,眼睛和衣服若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲 洗4. 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应也可以使用水 洗脱,但应该确保pH大于7.5, pH过低影响洗脱效率用水洗脱DNA应该 保存在一20°C°DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释5. PCR可能被过量的DNA (一般大于l^g抑制,使用最小用量的洗脱DNA (适 当稀释)反而可以得到更好的扩增一般加入的洗脱DNA体积不要超过总PCR 反应体积的10%我们建议在PCR反应体系中加入终浓度0.1 “g/的BSA (牛 血清白蛋白)有助于得到最佳扩增效果❖ 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)提示:第一次使用前请先在15ml漂洗液WB中加入60ml无水乙醇,充分混匀, 加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!1. 收集约200-220mg粪便到一个2ml离心管,置冰上。

如果是冰冻的标本,加入缓冲液ASL前不能解冻,否则DNA容易降解2. 加1.4ml缓冲液ASL,连续涡旋振荡1分钟或者直到完全混匀均一注意完全涡旋混匀,否则会严重降低产量3. 将重悬物70C温育5分钟该加热步骤可以提高3-5倍DNA产量,并且帮助裂解细菌和寄生虫对于某些 难裂解的细胞(如革兰氏阳性菌)可以提高到95°C4. 涡旋振荡15秒,室温放置1分钟最高速离心1分钟沉淀粪便颗粒5. 转移900皿上清到一个1.5ml离心管,加入100M杂质清除剂AB,立刻涡旋振荡 1分钟或者直到完全混匀均一,室温放置1分钟最高速离心3分钟去除杂质6. 转移所有上清到一个1.5ml离心管,最高速离心3分钟7. 转移210皿上清到一个1.5ml离心管,加入20皿蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混 匀,加入200皿结合液CB,涡旋振荡15秒,充分混匀70C温育10分钟如果产量偏低,可以转移更多的上清,并且相应的按比例提高蛋白酶K和结合液 的和后面的异丙醇使用量8. 冷却后加入100gl异丙醇,涡旋混匀9. 将上一步所得溶液和可能出现的沉淀都加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集 管中)13,000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。

10. 加入500gl抑制物去除液IR,12,000rpm离心30秒,弃废液11. 加入600gl漂洗液WB (请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm离心30秒, 弃掉废液12. 加入600gl漂洗液WB,12,000rpm离心30秒,弃掉废液13. 将吸附柱AC放回空收集管中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免 漂洗液中残留乙醇抑制下游反应14. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100—150gl 洗脱缓冲液EB (洗脱缓冲液可事先在65-70C水浴中预热),室温放置2分钟, 12,000rpm离心1分钟将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000rpm离心1分钟洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体 积,但是最小体积不应少于50“,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产 量15. DNA可以存放在2-8,如果要长时间存放,可以放置在一20°C问题与解决方法:问题评论与建议洗脫液没有 DNA或者产量低*样品储存不当-建议:样品应该储存在4C或者一20C*在缓冲液ASL中涡旋匀浆不充分-建议:样品在ASL中充分的涡 旋直到均一。

和结合液CB混匀不充分-建议:上清和结合液CB立即充分间断 涡旋混匀上离心柱前忘记加异丙醇-建议:记住加异丙醇* DNA洗脫不充分-建议:洗脫前在室温放5分钟*第一次使用前,漂洗液WB中忘记加无水乙醇-建议:在漂洗液 WB中加入指定量无水乙醇A260/A280比值异常高*残留RNA过高-建议:洗脫缓冲液加RNase A,室温10-30分钟DNA下游 反应不正常* BSA没有加到PCR反应体系-建议:PCR反应体系中加入终浓度 0.1 “g/的 BSA下游反应中使用的DNA过量了-建议:假如DNA使用太多,可能 会抑制PCR反应,因此可减少洗脫DNA使用量*非特异性扩增条带-建议:洗脫液中目的DNA量太低,背景DNA 过高,可以考虑使用热启动PCR聚合酶*某些目的细胞裂解困难,不充分导致产量低-建议:可以把裂解液 温育时间提高到95C*没有足够DNA洗脫下来-建议:查看上面可能的原因■问题 评论与建议最初的离心步骤第4步骤后没有 *离心力不够漣议:可以尝试14000rpm离心5分钟见到多少上清。

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